Tato práce prezentuje získané poznatky o biologickém čištění odpadních vod, zaměřené především na využití biofilmů. Biofilmy představují společenství bakterií, hub či jiných mikroorganizmů, které se mohou vyskytovat v rozmanitém prostředí. Dřevokazné houby a některé bakterie dokáží svými degradačními schopnostmi rozkládat polutanty, mezi které patří i syntetická barviva.
Studovány byly houbové kultury Pleurotus ostreatus a Irpex lacteus v interakci
s bakteriální kulturou Serratia marcescens. Fotografie získané pomocí fluorescenční a rastrovací elektronové mikroskopie dokazují koexistenci těchto kultur ve společenstvu. Data získaná během pokusu, potvrzují schopnost biofilmu částečně dekolorizovat syntetické barvivo Remazol Briliant Blue R.
Anotace v angličtině
This thesis presents acquired knowledge of biological wastewater treatment, focused on using the biofilms. Biofilms constitute biocoenosis of bacteria, fungi or other microorganisms, which might occur in various environment. Wood-decay fungi and some bacteria with its degradation capabilities can decay pollutants, including synthetic dyes.Studied was interaction of Pleurotus ostreatus and Irpex lacteus fungi cultures with Serratia marcescens bacteria culture. Photographs acquired by fluorescence microscope and scanning electron microscope proves coexistence of these cultures in biocoenosis.Data acquired in laboratory experiments prove the capability of the biofilm to partially decolorize Remazol Briliant Blue R synthetic dye.
Klíčová slova
Irpex lacteus, Pleurotus ostreatus, Serratia marcescens, dekolorizace, biofilm, odpadní vody
Tato práce prezentuje získané poznatky o biologickém čištění odpadních vod, zaměřené především na využití biofilmů. Biofilmy představují společenství bakterií, hub či jiných mikroorganizmů, které se mohou vyskytovat v rozmanitém prostředí. Dřevokazné houby a některé bakterie dokáží svými degradačními schopnostmi rozkládat polutanty, mezi které patří i syntetická barviva.
Studovány byly houbové kultury Pleurotus ostreatus a Irpex lacteus v interakci
s bakteriální kulturou Serratia marcescens. Fotografie získané pomocí fluorescenční a rastrovací elektronové mikroskopie dokazují koexistenci těchto kultur ve společenstvu. Data získaná během pokusu, potvrzují schopnost biofilmu částečně dekolorizovat syntetické barvivo Remazol Briliant Blue R.
Anotace v angličtině
This thesis presents acquired knowledge of biological wastewater treatment, focused on using the biofilms. Biofilms constitute biocoenosis of bacteria, fungi or other microorganisms, which might occur in various environment. Wood-decay fungi and some bacteria with its degradation capabilities can decay pollutants, including synthetic dyes.Studied was interaction of Pleurotus ostreatus and Irpex lacteus fungi cultures with Serratia marcescens bacteria culture. Photographs acquired by fluorescence microscope and scanning electron microscope proves coexistence of these cultures in biocoenosis.Data acquired in laboratory experiments prove the capability of the biofilm to partially decolorize Remazol Briliant Blue R synthetic dye.
Klíčová slova
Irpex lacteus, Pleurotus ostreatus, Serratia marcescens, dekolorizace, biofilm, odpadní vody
Cílem práce bude popis interakcí houba-baktérie v systému
imobilizovaného biofilmu s potenciálním využití pro čištění odpadních
vod na základě literární rešerže. Praktická část bude zahrnovat
kultivaci směsného houbového a bakteriálního biofilmu v laboratorních
podmínkách a sledování jeho morfologie. K tomuto bude využita optická a
především rastrovací elektronová mikroskopie. Základem pro práci je
schopnost čerpat z anglické vědecké literatury a využívat databázové
zdroje UJEP a případně i MBÚ AV ČR. Kultivace biofilmu bude zajištěna
ve spolupráci se skupinou Doc. RNDr. Čeňka Novotného, CSc. (Mgr. Hana
Mikesková) z Mikrobiologického ústavu AV ČR. Morfologická studia budou
provedena pod vedením RNDr. Oldřicha Benady, CSc. v Mikrobiologickém
ústavu AV ČR v Praze a na KBI UJEP v Ústí nad Labem.
Zásady pro vypracování
Cílem práce bude popis interakcí houba-baktérie v systému
imobilizovaného biofilmu s potenciálním využití pro čištění odpadních
vod na základě literární rešerže. Praktická část bude zahrnovat
kultivaci směsného houbového a bakteriálního biofilmu v laboratorních
podmínkách a sledování jeho morfologie. K tomuto bude využita optická a
především rastrovací elektronová mikroskopie. Základem pro práci je
schopnost čerpat z anglické vědecké literatury a využívat databázové
zdroje UJEP a případně i MBÚ AV ČR. Kultivace biofilmu bude zajištěna
ve spolupráci se skupinou Doc. RNDr. Čeňka Novotného, CSc. (Mgr. Hana
Mikesková) z Mikrobiologického ústavu AV ČR. Morfologická studia budou
provedena pod vedením RNDr. Oldřicha Benady, CSc. v Mikrobiologickém
ústavu AV ČR v Praze a na KBI UJEP v Ústí nad Labem.
Seznam doporučené literatury
Frey-Klett, P.; Burlinson, P.; Deveau, A.; Barret, M.; Tarkka, M. &
Sarniguet, A. (2011), 'Bacterial-fungal interactions: hyphens between
agricultural, clinical, environmental, and food microbiologists.',
Microbiol Mol Biol Rev 75(4), 583-609
Hogan, D. A.; Wargo, M. J. & Beck, N. (2009), 'Bacterial biofilms on
fungal surfaces'
Kjelleberg, S. & Givskov, M. (2007), 'The biofilm mode of life', The
biofilm mode of life: mechanisms and adaptations, 5-21
Kjelleberg, S. & Givskov, M. (2007), The biofilm mode of life:
mechanisms and adaptations, Horizon Scientific Press
Rulík, M.; Holá, V.; Růžička, F.; Votava, M.; Baudišová, D.; Gallo, J.;
Kaprálová, S.; Kohušová, K.; Koukalová, D.; Kůdela, V.; Mikeš, J.;
Novotný, R.; Siglová, M.; Toršová, V. & Zimák, J. (2011), Mikrobiální
biofilmy, Univerzita Palackého v Olomouci, Olomouc
Seznam doporučené literatury
Frey-Klett, P.; Burlinson, P.; Deveau, A.; Barret, M.; Tarkka, M. &
Sarniguet, A. (2011), 'Bacterial-fungal interactions: hyphens between
agricultural, clinical, environmental, and food microbiologists.',
Microbiol Mol Biol Rev 75(4), 583-609
Hogan, D. A.; Wargo, M. J. & Beck, N. (2009), 'Bacterial biofilms on
fungal surfaces'
Kjelleberg, S. & Givskov, M. (2007), 'The biofilm mode of life', The
biofilm mode of life: mechanisms and adaptations, 5-21
Kjelleberg, S. & Givskov, M. (2007), The biofilm mode of life:
mechanisms and adaptations, Horizon Scientific Press
Rulík, M.; Holá, V.; Růžička, F.; Votava, M.; Baudišová, D.; Gallo, J.;
Kaprálová, S.; Kohušová, K.; Koukalová, D.; Kůdela, V.; Mikeš, J.;
Novotný, R.; Siglová, M.; Toršová, V. & Zimák, J. (2011), Mikrobiální
biofilmy, Univerzita Palackého v Olomouci, Olomouc