| Název předmětu | Počítačové modelování biologických systémů |
|---|---|
| Kód předmětu | KI/KPMBS |
| Organizační forma výuky | Seminář |
| Úroveň předmětu | Magisterský |
| Rok studia | 2 |
| Semestr | Letní |
| Počet ECTS kreditů | 2 |
| Vyučovací jazyk | Čeština |
| Statut předmětu | Povinně-volitelný |
| Způsob výuky | Kontaktní |
| Studijní praxe | Nejedná se o pracovní stáž |
| Doporučené volitelné součásti programu | Není |
| Vyučující |
|---|
|
| Obsah předmětu |
|
1. Počítačový model biologického systému, jeho formulace a matematický aparát, vztah systém-signál, lineární a nelineární odezva systému, současné aplikace počítačových modelů 2. Počítačové modely jednoduchých systémů, vztahy mezi parametry modelu, vizualizace, lineární, nelineární a fyzikálně-chemické modely biologických systémů 3. - 4. Modelování rozsáhlých biologických systémů, populační, migrační nebo epidemiologické modely, matematický popis, aplikace na vybrané události a porovnání s veřejně dostupnými daty (např. datový repositář Světové zdravotnické organizace) 5. - 8. Modelování biologických systémů s odezvou ve formě fyziologického signálu, definice nejvíce používaných signálů (EKG, EEG, EMG), jejich měření a interpretace výsledků, aplikace lineárních a nelineárních modelů na vybrané události v signálech, porovnání výsledků s reálnými signály dostupnými ve veřejných databázích 9. Diskuse zadání seminární práce na téma modelování rozsáhlých biologických systémů nebo modelování biologických systémů s odezvou ve formě fyziologického signálu, definice problému, zdroje dat, specifikace výstupu práce a její relevance k aktuálně řešeným problematikám
|
| Studijní aktivity a metody výuky |
| nespecifikováno |
| Výstupy z učení |
|
V rámci předmětu jsou aplikovány počítačové metody a přístupy pro modelování biologických systémů. V první části předmětu jsou nejprve představeny systémy s lineární a nelineární odezvou a s nimi spojené modely a algoritmy. Dále jsou představeny modely komplexních biologických systémů (celá populace). Jde například o modelování postupu migrace nebo šíření virové infekce. Nejvíce prostoru je věnováno modelům zaměřeným na popis uzavřeného biologického systému, jehož výstupem je fyziologický signál (EKG, EMG nebo EEG). Postupně jsou aplikovány modely popisující určité události v jednotlivých signálech. Výsledky modelování jsou porovnávány s daty z veřejně dostupných databází.
|
| Předpoklady |
|
nespecifikováno
|
| Hodnoticí metody a kritéria |
|
nespecifikováno
Seminární práce |
| Doporučená literatura |
|
|
| Studijní plány, ve kterých se předmět nachází |
| Fakulta | Studijní plán (Verze) | Kategorie studijního oboru/specializace | Doporučený semestr |
|---|