| Název předmětu | Počítačové metody molekulárních simulací - molekulární dynamika |
|---|---|
| Kód předmětu | KFY/PM305 |
| Organizační forma výuky | Přednáška + Cvičení |
| Úroveň předmětu | Doktorský |
| Rok studia | nespecifikován |
| Semestr | Zimní a letní |
| Počet ECTS kreditů | 0 |
| Vyučovací jazyk | Čeština |
| Statut předmětu | Povinně-volitelný |
| Způsob výuky | Kontaktní |
| Studijní praxe | Nejedná se o pracovní stáž |
| Doporučené volitelné součásti programu | Není |
| Vyučující |
|---|
|
| Obsah předmětu |
|
nespecifikováno
|
| Studijní aktivity a metody výuky |
| nespecifikováno |
| Výstupy z učení |
|
Kurz je určený zejména studentům, kteří se v rámci své dizertační práce zabývají počítačovými simulacemi dynamických vlastností molekulárních soustav a jejich chováním mimo termodynamickou rovnováhu. Kurz prohlubuje a rozšiřuje studentovy znalosti a dovednosti v oblasti metod molekulární dynamiky (MD): - MD v různých statistických souborech a řešení pohybových rovnic (SHAKE/RATTLE a RESPA algoritmy). - MD simulace transportních vlastností (viskozita, vodivost). - Parinellova-Rahmanova MD (NPT MD se změnou tvaru simulačního boxu): pohybové rovnice pro atomární a molekulární krystaly a jejich numerické řešení; interakční potenciály atomů v krystalech. - MD simulace atomárních a molekulárních krystalů: simulace mechanických vlastností a fázových přechodů. - Nerovnovážné MD simulace atomárních a molekulárních krystalů: šíření rázů v krystalech. - Nerovnovážná MD a její použití pro simulaci transportních vlastností (viskozita, vodivost). - Teplotní difuze a Soretův koeficient. - Poiseuilleho proudění a transport v pórech. - Couettovo proudění. - Osmotické a difuzně-osmotické proudění.
|
| Předpoklady |
|
nespecifikováno
|
| Hodnoticí metody a kritéria |
|
nespecifikováno
|
| Doporučená literatura |
|
|
| Studijní plány, ve kterých se předmět nachází |
| Fakulta | Studijní plán (Verze) | Kategorie studijního oboru/specializace | Doporučený semestr |
|---|