- První blok bude zaměřený na charakteristické vlastnosti biologických vzorků s ohledem na jejich analýzu v elektronových mikroskopech (TEM i SEM). - Druhý blok bude věnovaný klasické přípravě preparátů pro transmisní elektronový mikroskop. Budou probrány základní metody přípravy preparátů biologických makromolekul, prokaryotických i eukaryotických buněk a biologických tkání. - Třetím blok se bude zabývat moderními přístupy kryo transmisní elektronové mikroskopie a zvláštnostmi záznamu obrazu. V tomto bloku budou rovněž probrány nové poznatky získané touto obtížnou a specifickou technologií. - Čtvrtý blok bude obdobný druhému bloku s tím, že stejným přístupem pojedná o klasické přípravě biologického materiálu pro rastrovací elektronový mikroskop. Zahrnuty budou i moderní přístupy k záznamu obrazu v různých módech rastrovací elektronového mikroskopu za využití specifických detektorů i nastavení podmínek pozorování. - V pátém bloku bude probírána kryo rastrovací elektronová mikroskopie a její možnosti v biologických aplikacích. - Šestý blok bude věnován specificitám digitálního záznamu obrazu v TEM s důrazem na správný výběr vhodného způsobu mikroskopování klasických biologických vzorků. Důraz bude položen na správně vybrané podmínky mikroskopování, které zaručí optimální požadované rozlišení digitální obrazu vzorku. - Sedmý blok bude věnován zpracování digitálního obrazu v transmisní elektronové mikroskopii včetně základních metod analýzy obrazu (např. analýza částic). - Osmý blok bude variantou šestého bloku se zaměřením na rastrovací elektronovou mikroskopii a možnostem digitálního záznamu obrazu vzhledem ke specifickým vlastnostem biologických vzorků. - V devátý blok se dotkne etiky v digitálním zobrazování s důrazem na "co je dovoleno a co je zakázáno" při digitálním zpracování obrazových dat pro vědecké účely. Náplň bude zahrnovat informace o tom, co je to vědecká integrita a co lze považovat za její porušení při presentaci digitálních obrazů biologických vzorků. Bloky budou doplněny příklady publikací, které vznikly při řešeních konkrétních biologických projektů. Bude nastíněn problém, který byl řešen metodami elektronové mikroskopie, vysvětlena zvolená metodika, zpracování vzorků, strategie záznamu obrazu i finální presentace obrazových dat. Praktická část výuky bude zaměřena na demonstraci přípravy biologických vzorků k mikroskopování, pořízení mikroskopických snímků a jejich analýzu.
|