Předmět: Poč. modelování částicových soustav II

« Zpět
Název předmětu Poč. modelování částicových soustav II
Kód předmětu KFY/M201
Organizační forma výuky Přednáška + Cvičení
Úroveň předmětu Magisterský
Rok studia 1
Semestr Letní
Počet ECTS kreditů 5
Vyučovací jazyk Čeština
Statut předmětu Povinný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Moučka Filip, doc. RNDr. Ph.D.
  • Svoboda Martin, Mgr. Ph.D.
Obsah předmětu
1. Upřesnění základních pojmů a myšlenek částicového modelování. Mechanický, termodynamický a statisticko-fyzikální popis soustav: mikroskopické modely, interakční energie, pohybové rovnice, termodynamické vlastnosti, statistické soubory. 2. Metody Monte Carlo v částicovém modelování: Markovovy řetězce, matice přechodu, Metropolisova metoda, separace hybnostního a konfiguračního prostoru. 3. Realizace Metropolisova algoritmu v kanonickém souboru a periodických podmínkách: počáteční konfigurace, translace, rotace, zlomky přijetí, konvergence, ekvilibrace, energetické tail korekce interakčních potenciálů. 4. Výpočet termodynamických veličin přímo z mechanických veličin: vnitřní energie, tlak, viriál síly, virtuální změna objemu, kompresibilita. 5. Výpočet strukturních veličin - radiální distribuční funkce, prostorová distribuční funkce, strukturní faktor, analýza vodíkových vazeb, souvislost struktury a termodynamiky. 6. Výpočet entropických veličin: volná energie, chemický potenciál, termodynamická integrace, virtuální vkládání. 7. Interakční potenciály dlouhého dosahu: elektrostatické interakce, bodové a Gaussovské náboje, bodový dipól, Ewaldova sumace, metody reakčního pole a další přibližné metody. 8. MC simulace v izobaricko-izotermickém souboru. 9. MC simulace v grandkanonickém souboru. 10. MC simulace fázových rovnováh v Gibbsově souboru. 11. Speciální metody vzorkování: Force bias, Smart MC, preferenční vzorkování, neboltzmannovské vzorkování. 12. Polarizovatelné modely a metody pro jejich řešení: bodový indukovaný dipól, náboj na pružině, iterační metody. 13. Optimalizace simulačních programů: profilování simulačních programů, aproximace interakčních potenciálů, metoda zřetězených seznamů, metoda seznamu sousedů.

Studijní aktivity a metody výuky
nespecifikováno
Výstupy z učení
Kurz rozšiřuje znalosti získané v kurzu Počítačové modelování částicových soustav I o hlubší teoretický popis opírající se o znalosti termodynamiky a statistické fyziky, což umožní výklad rozšířit o metody Monte Carlo (MC) a hlubší výklad potřebný pro implementaci vlastních simulačních programů. Výsledkem každého cvičení bude vytvoření vlastního simulačního programu využívajícího metod vyložených v rámci předcházejících přednášek. Cílem kurzu je rozvinout schopnost studentů vytvářet vlastní simulační programy a vyvíjet nové vlastní postupy v oblasti částicových simulací:

Předpoklady
nespecifikováno
KFY/M101 a zároveň KFY/KSF
----- nebo -----
KFY/MK105
----- nebo -----
KFY/M105
----- nebo -----
KFY/SF

Hodnoticí metody a kritéria
nespecifikováno
protokoly o samostatném řešení zadaných úloh, ústní zkouška
Doporučená literatura


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr