|
Vyučující
|
-
Malý Marek, doc. RNDr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
nespecifikováno
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
|
nespecifikováno
|
|
Výstupy z učení
|
Praktika počítačového modelování I, II, III jsou zaměřena na rozvoj schopnosti studentů samostatně řešit úlohy z vybraných oblastí probraného učiva či aplikovat získané znalosti na řešení dalších praktických problémů. Studenti zde tedy prakticky procvičují příslušné počítačové algoritmy, ale i zvolený programovací jazyk či práci s relevantním software. Praktikum III je věnováno samostatnému procvičení témat z kurzu ?Počítačové metody ? Monte Carlo?, dále pak simulacím vybraných částicových systémů pomocí metody Molekulární dynamika (MD) či Monte Carlo, atomistickým simulacím s empirickým silovým polem (MD) a vybraným fyzikálním problémům z dalších oblastí (např. spojitého modelování). Příklady témat: integrace funkcí mnoha proměnných, vzorkování rozličných pravděpodobnostních rozdělení a odhady středních hodnot, Laplaceova úloha (porovnání efektivity MC vs deterministický numerický výpočet (průměrování) (2D a 3D)), simulace ?polymerního? řetízku částic interagujících vzájemně vazebným a Lennard- Jonesovým (LJ) potenciálem při dané teplotě (závislost střední hodnoty gyračního poloměru na teplotě), ohřev vody ve slunečním kolektoru (stacionární/nestacionární fáze, výstupní teplota a účinnost kolektoru jakožto funkce průtoku) aj., simulace vybraných molekulárních systémů na atomární úrovni a jejich analýzy (strukturní, vazebné energie, difuze - Materials Studio, Amber).
|
|
Předpoklady
|
nespecifikováno
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
nespecifikováno
vyřešení všech zadaných zápočtových úloh a odevzdání příslušných protokolů
|
|
Doporučená literatura
|
-
Frenkel D., Smit B. Understanding Molecular Simulation. From Algorithms to Applications. Academic Press, 1996.
-
Hrach, R. Počítačová fyzika I, PF UJEP, Ústí nad Labem, 2003. ISBN 80-7044-521-1.
-
Kolafa Jiří. Molekulové modelování a simulace, VŠCHT Praha, 2019 ( https://web.vscht.cz/~kolafaj.
|