| Název předmětu | Molekulární simulace polarizovaných modelů tekutin |
|---|---|
| Kód předmětu | KFY/0235 |
| Organizační forma výuky | Přednáška + Cvičení |
| Úroveň předmětu | Bakalářský |
| Rok studia | nespecifikován |
| Semestr | Zimní a letní |
| Počet ECTS kreditů | 3 |
| Vyučovací jazyk | Čeština |
| Statut předmětu | Povinně-volitelný |
| Způsob výuky | Kontaktní |
| Studijní praxe | Nejedná se o pracovní stáž |
| Doporučené volitelné součásti programu | Není |
| Vyučující |
|---|
|
| Obsah předmětu |
|
nespecifikováno
|
| Studijní aktivity a metody výuky |
| nespecifikováno |
| Výstupy z učení |
|
Většina molekulárních modelů tekutin i pevných látek vychází z přibližného předpokladu párové aditivity konfigurační energie. Takové modely lze simulovat pomocí běžných programů, např. LAMMPS, GROMACS, AMBER. Párově aditivní modely však trpí mnohými problémy, např. nesprávně popisují fázové rovnováhy, odezvu na elektrická pole, zpomalují dynamiku roztoků. Tyto potíže principiálně překonávají modely, které nezanedbávají polarizaci molekul. Simulace polarizovatelných modelů jsou však složitější, výpočetně nákladnější, vyžadují speciální techniky a nelze je provádět v běžných simulačních programech. Cílem výběrového kurzu je seznámit studenty s principem polarizace molekul, jeho modelováním (bodový indukovaný dipól, Drude částice na pružinách), simulačními metodami pro řešení polarizovatelných modelů (iterace dipólů a Drude částic, mnohačásticové kroky Monte Carlo). Studenti budou vyvíjet vlastní molekulárně-simulační programy, od jednoduchých výpočtů interakční energie dvou polarizovatelných částic až po simulaci moderních polarizovatelných modelů v periodických okrajových podmínkách.
|
| Předpoklady |
|
Základy programování fortran nebo C, základy molekulárních simulací.
|
| Hodnoticí metody a kritéria |
|
nespecifikováno
Odevzdání protokolu o samostatném řešení zadané úlohy: |
| Doporučená literatura |
|
|
| Studijní plány, ve kterých se předmět nachází |
| Fakulta | Studijní plán (Verze) | Kategorie studijního oboru/specializace | Doporučený semestr | |
|---|---|---|---|---|
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Fyzika (dvouoborové) (A14) | Kategorie: Fyzikální obory | - | Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: - |
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Aplikované nanotechnologie (A12) | Kategorie: Speciální a interdisciplinární obory | - | Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: - |