1.- 2. Struktura a funkce bílkovin a nukleových kyselin. Struktura bílkovin; enzymy; modulární struktura proteinů; struktura a funkce nukleových kyselin; párování basí, denaturace, renaturace a hybridizace nukleových kyselin; další sekundární struktury NK; vyšší struktury DNA 3.- 4. Genetický kód, transferová DNA. Základní vlastnosti genetického kódu; čtení genetického kódu, struktura genu a mRNA; struktura mRNA a okolí startovacího kodonu; transferová RNA; aminoacyl-tRNA syntetázy; kolísání antikodonu; vývoj genetického kódu;regulace elongace transkripce; terminace transkripce; posttranskripční úpravy a stabilita RNA; 12. Sestřih (splicing) a jiné úpravy primárního transkriptu Sestřih mRNA jaderných genů; sestřih mitochondriálních intronů skupin I a II; alternativní sestřih; trans-splicing; sestřih transkriptů tRNA genů; katalytická aktivita RNA; ribozymy; sestřih ribosomální RNA; editování RNA; 13. Transposony DNA transposony; bakteriální transposony; transposony kukuřice a Drosophily; RNA transposony (retroposony) a retroviry; reversní transkripce retrovirů a integrace do genomu; transkripce a translace retrovirů; vznik virionů; 14. Viry a bakteriofágy Morfologie virů; virové genomy a replikační strategie; replikační strategie živočišných a rostlinných RNA virů; satelitní viry, satelitní RNA, virusoidy a viroidy; DNA retroviry (pararetroviry); replikační strategie eukaryotních DNA virů; bakteriofágy; 15. Metody molekulární biologie Metody izolace nukleových kyselin; Elektroforéza a její variace; Práce s enzymy; Rekombinantní DNA; Vektory, exprese proteinů; Mutageneze DNA, transformace organismů; Konstrukce RNA a DNA sond; Hybridizace nukleových kyselin; Southern, Nothern a Western blotting; Princip a variace polymerázové řetězové reakce (PCR); In vitro mutageneze, interakce DNA a proteinů; Mikrosatelitová DNA, DNA fingerprinting; Metody RFLP a RAPD; polymerázová řetězová reakce (PCR); DNA čipy; Proteinové čipy. odchylky v kódování; UGA jako selenocysteinový kodon; supresorové mutace; 5. Translace Základní schéma translace; mRNA a nasedání ribosomů; iniciace translace; elongace; translokace; terminace; struktura ribosomů; translační chyby; antibiotika působící na bakteriální translaci; regulace exprese genů na úrovni translace; 6. Posttranslační modifikace, transport a degradace proteinů Ustavení terciární struktury proteinů; řízená degradace proteinů; ubiquitinový systém degradace proteinů; transport proteinů v buňce; modifikace a sorting proteinů v ER a v Golgi aparátu; funkční modifikace proteinů;fosforylace; 7. Transkripce u prokaryot. Regulace genové exprese na úrovni transkripce. RNA polymeráza; vazba na promotor a aktivace RNAP; struktura promotoru; iniciace mRNA a opuštění promotoru; kontrola exprese genů na úrovni iniciace transkripce; negativní inducibilní regulace laktosového operonu; elongace; terminace transkripce; regulace pomocí antisense RNA; úpravy primárního transkriptu u prokaryot; 8. Replikace DNA. Plasmidy Obecný mechanismus replikace; DNA polymerázy; iniciace replikace v ori a primosomy prokaryot; topologické problémy při rozplétání dvoušroubovice DNA; replikační strategie; replikace chromosomu Escherichia coli; regulace replikace; eukaryotní replikace; bakteriální plasmidy; mechanismy replikace a systém plasmidů; 9. Postreplikační modifikace DNA Metylační systémy E. coli; Restrikčně modifikační systémy baktérií; metylace basí u eukaryot; reparační systémy E. coli; reparace dvouřetězcových zlomů; SOS reakce u E. coli; homologní rekombinace; specializovaná rekombinace; 10. Struktura sekvencí DNA eukaryotního genomu Paradox C-hodnoty; Přerušované geny; exony a introny; genové rodiny; vznik, vývoj a evoluční stabilizace genových rodin; silně repetitivní DNA; organelové genomy; 11. Transkripce u eukaryot RNA polymerázy, jejich promotory a basální inciační aparát; interakce transkripčních faktorů s proteiny a s DNA;
|
-
Bustin S. Molecular Biology of the Cell, Sixth Edition; ISBN: 9780815344643; and Molecular Biology of the Cell, Sixth Edition, The Problems Book; ISBN 9780815344537. Richter ML, ed. International Journal of Molecular Sciences. 2015;16(12):28123-28125. doi:10.3390/ijms161226074..
-
OTOVÁ, B; et al. Základy biologie a genetiky člověka. Prague, Czech Republic: Charles University in Prague, Karolinum Press, 2012. (Učební texty Univerzity Karlovy v Praze).. ISBN 9788024621098.
-
Voet, D., & Voet, J. G. Biochemistry. Hoboken, NJ: John Wiley & Sons. 2011.
-
Watson, J. D., Baker, T. A., Bell, S. P., Gann, A., Levine, M., & Losick, R. M. Molecular biology of the gene. 2004.
|