1. Předmět biometriky, základní biometrické pojmy a charakteristika biometrických dat. Populace, výběr, typy proměnných; kvalita měření (přesnost, správnost, nejistota; objektivita, reliabilita, validita); výzkumný plán (cenzus, výběrové šetření, experiment, případová studie); plánování pokusu. 2. Základy kombinatoriky a počtu pravděpodobnosti. Variace, kombinace, permutace; binomická věta. Náhodný pokus, náhodný jev, náhodná veličina, podmíněná pravděpodobnost. 3. Distribuční funkce a pravděpodobnostní rozdělení. Náhodná proměnná; distribuční funkce; rozdělení normální, binomické, Poissonovo, log-normální. 4. - 6. Formulace a testování hypotéz. Hypotézy (nulová, alternativní; o poloze, o rozptylu, o relativní četnosti, o vychýlených hodnotách); testování hypotéz, chyba 1. a 2. druhu. Parametrické a neparametrické testy (t-test, u-test, F-test, ?2 -test, mediánový test, Wilcoxonův, Grubbsův test, Kruskal - Wallisův test, plus-minus test). 7. Analýza kategoriálních dat. Jednoduché hodnocení četností, ?2 -test dobré shody, závislost kategoriálních proměnných, ordinální kategoriální data. 8. Analýza rozptylu. ANOVA, analýza rozptylu při jednoduchém třídění, analýza rozptylu při dvojném třídění, analýza rozptylu s opakováním měření; randomizace. 9. - 10. Regresní a korelační analýza. Mnohonásobná lineární regrese, mnohonásobný regresní model, regresní a korelační koeficienty, regresní rovnice. Analýza kovariance, ANCOVA. 11. - 12. Základy vícerozměrné analýzy a modelování v biologii. Funkce přežití; shluková analýza, diskriminační analýza, faktorová analýza. 13. - 14. Statistické programy a biologické databáze. STATISTIKA; SigmaPlot; databáze sekvenční, strukturní, genomové (NCBI, EMBL, FlyBase, SCOP, GenBank, PDB, NDB).
|
Cílem tohoto kurzu je poskytnout informace o základních metodách biometrické analýzy a vyhodnocení experimentálně získaných údajů. Hlavní témata kurzu: počet pravděpodobnosti, distribuce, hypotézy, vybrané statistické testy, analýza rozptylu, korelační a regresní analýza; plánování pokusů, výběr a komparace vzorků, náhodný proces, náhodný vzorek, znáhodnění. V kurzu jsou zařazena praktická cvičení. Podmiňující předměty nejsou požadovány.
|
-
Benedík J. Biostatistika. Brno, 1989.
-
Brabec, M. Moderní analýza biologických dat 1. Scientia, Praha 2009.
-
Cvrčková Fatima. Úvod do praktické bioinformatiky, Academia, (2006).
-
Gavalec M., Poláček M. Biomatematika. Príroda Bratislava, 1990.
-
HENDL, J. Přehled statistických metod zpracování dat.. Praha: Portál, 2004. ISBN 80-7178-820-1.
-
Kubánková H., Hendl J. Statistika pro zdravotníky.. Mzd Praha 1982, 1987.
-
Michálek J. a kol. Biometrika. SPN Praha, 1982.
-
Pekár, S., Brabec, M. Moderní analýza biologických dat 2. Masarykova Univerzita, Brno 2012.
-
Stávková, J., Dufek, J. Biometrika (skriptum). MZLU, Brno 2000.
|