Univerzita Jana Evangelisty Purkyně v Ústí nad Labem
Studijní programy a katalog předmětů
pro akademický rok 2024/2025
Univerzita Jana Evangelisty Purkyně v Ústí nad Labem
English
Hledání

Předmět: Biometrika

« Zpět
Název předmětu Biometrika
Kód předmětu KBI/P329
Organizační forma výuky Cvičení
Úroveň předmětu Bakalářský
Rok studia 2
Semestr Zimní a letní
Počet ECTS kreditů 3
Vyučovací jazyk Čeština
Statut předmětu Povinně-volitelný
Způsob výuky nespecifikováno
Studijní praxe nespecifikováno
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Ipser Jan, RNDr. CSc.
Obsah předmětu
1. Předmět biometriky, základní biometrické pojmy a charakteristika biometrických dat. Populace, výběr, typy proměnných; kvalita měření (přesnost, správnost, nejistota; objektivita, reliabilita, validita); výzkumný plán (cenzus, výběrové šetření, experiment, případová studie); plánování pokusu. 2. Základy kombinatoriky a počtu pravděpodobnosti. Variace, kombinace, permutace; binomická věta. Náhodný pokus, náhodný jev, náhodná veličina, podmíněná pravděpodobnost. 3. Distribuční funkce a pravděpodobnostní rozdělení. Náhodná proměnná; distribuční funkce; rozdělení normální, binomické, Poissonovo, log-normální. 4. - 6. Formulace a testování hypotéz. Hypotézy (nulová, alternativní; o poloze, o rozptylu, o relativní četnosti, o vychýlených hodnotách); testování hypotéz, chyba 1. a 2. druhu. Parametrické a neparametrické testy (t-test, u-test, F-test, ?2 -test, mediánový test, Wilcoxonův, Grubbsův test, Kruskal - Wallisův test, plus-minus test). 7. Analýza kategoriálních dat. Jednoduché hodnocení četností, ?2 -test dobré shody, závislost kategoriálních proměnných, ordinální kategoriální data. 8. Analýza rozptylu. ANOVA, analýza rozptylu při jednoduchém třídění, analýza rozptylu při dvojném třídění, analýza rozptylu s opakováním měření; randomizace. 9. - 10. Regresní a korelační analýza. Mnohonásobná lineární regrese, mnohonásobný regresní model, regresní a korelační koeficienty, regresní rovnice. Analýza kovariance, ANCOVA. 11. - 12. Základy vícerozměrné analýzy a modelování v biologii. Funkce přežití; shluková analýza, diskriminační analýza, faktorová analýza. 13. - 14. Statistické programy a biologické databáze. STATISTIKA; SigmaPlot; databáze sekvenční, strukturní, genomové (NCBI, EMBL, FlyBase, SCOP, GenBank, PDB, NDB).

Studijní aktivity a metody výuky
nespecifikováno
Výstupy z učení
Kurz je zaměřen na základní biometrické metody a přístupy, používané při plánování experimentů, sběru experimentálních dat a jejich zpracování. Jednotlivé tematické okruhy jsou probírány převážně prostřednictvím praktického řešení vzorových úloh tak, aby absolventi kurzu byli schopni získané poznatky samostatně aplikovat při vlastní experimentální činnosti. Část programu kurzu je zaměřena na práci s biologickými databázemi a na tvorbu jednoduchých matematických modelů.

Předpoklady
Základní znalosti z matematické statistiky.

Hodnoticí metody a kritéria
nespecifikováno
Na cvičení je probírána především problematika plánování pokusu, statistických jevů, testování hypotéz a jsou řešeny typové příklady. Frekventantům kurzu jsou poskytnuty základní informace o vybraných biologických databázích a práci s nimi. Významná část programu kurzu je předmětem samostudia z dostupných zdrojů. Jako konkrétní formu kontroly samostudia každý frekventant vypracuje tři úlohy (jednu zaměřenou na aplikaci parametrických metod, jednu na aplikaci neparametrických metod a jednu na vytvoření jednoduchého modelu určité struktury nebo procesu za využití vhodné biologické databáze).
Doporučená literatura
  • Benedík J. Biostatistika. Brno, 1989.
  • Brabec, M. Moderní analýza biologických dat 1. Scientia, Praha 2009.
  • Cvrčková Fatima. Úvod do praktické bioinformatiky, Academia, (2006).
  • Gavalec M., Poláček M. Biomatematika. Príroda Bratislava, 1990.
  • HENDL, J. Přehled statistických metod zpracování dat.. Praha: Portál, 2004. ISBN 80-7178-820-1.
  • Kubánková H., Hendl J. Statistika pro zdravotníky.. Mzd Praha 1982, 1987.
  • Michálek J. a kol. Biometrika. SPN Praha, 1982.
  • Pekár, S., Brabec, M. Moderní analýza biologických dat 2. Masarykova Univerzita, Brno 2012.
  • Stávková, J., Dufek, J. Biometrika (skriptum). MZLU, Brno 2000.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biologie (A14) Kategorie: Biologické obory 2 Doporučený ročník:2, Doporučený semestr: Zimní
Univerzita Jana Evangelisty Purkyně v Ústí nad Labem, data aktuální k: 01.11.2024 23:51. Data byla vytvořena pro akademický rok 2024/2025