|
Vyučující
|
|
|
|
Obsah předmětu
|
Obsah přednášky: Úvod - proč nás zajímá biologie půdy? - charakteristiky půdních mikroorganismů - v půdě žijí nejen mikroorganismy (makroskopické organismy - živočichové a rostliny) - koncept ekologické niky aneb proč v půdě žije tolik různých organismů? Diverzita půdních organismů - jaké skupiny organismů v půdě žijí? - koncept trofických sítí - úlohy jednotlivých skupin organismů - biologická aktivita půdy Půda jako předpoklad i výsledek funkce živých organismů - abiotické složky půdy a fyzikální a chemické parametry půdního prostředí, voda - labilní a stabilní půdní organická hmota - vznik půdy a vývoj půdních horizontů - stabilita půdy a její vztah k živým organismům Minerální živiny v půdě - sorpční komplex, chování hlavních makrobiogenních živin v půdě, rovnováha mezi vázanými a rozpuštěnými formami živin, vliv půdních mikroorganismů na dostupnost makrobiogenních živin Půda jako substrát pro růst rostlin - rhizosféra - půda jako zdroj symbiotických mikroorganismů - fixace molekulárního dusíku půdními mikroorganismy - hlavní metabolické dráhy přeměn dusíku v půdě - špatně dostupný fosfor - solubilizace fosfátových minerálů působením mikroorganismů a ekonomika příjmu fosfátu rostlinami Obsah cvičení: - Stanovení půdní vlhkosti, koncentrace oxidovatelného uhlíku v půdě, pH půdy - Stanovení rychlosti půdní respirace - Stanovení obsahu bazických kationtů vytěsněním octanem amonným, stanovení pufrovitosti půdy - Stanovení stability půdních agregátů - Mikroflóra volné půdy (kultivační kvantifikace bakteriální a houbové složky), mikrobiální antagonismus - Rhizosféra/mykorhizosféra a její obyvatelé - Půdní mikrofauna a mezofauna
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
|
nespecifikováno
|
|
Výstupy z učení
|
Přednáškový cyklus si dává za cíl seznámit studenty magisterského studia s novými směry v molekulární biologii a genetice základních buněčných dějů u bakterií. Jednotlivé přednášky jsou řazeny do navazujících tematických okruhů od struktury genomu a jeho evoluce, přes regulaci exprese genů, modifikaci proteinů, regulaci dělení buněk, adaptaci na změny vnějšího prostředí, stres, přenos signálů a signální systémy, diferenciaci buněčných populací, až po metagenomiku a syntetickou biologii. Přednášky budou řazeny do logických celků a budou zpestřeny externisty, kteří se specializují v daném oboru. Tematické okruhy mohou být modifikovány dle pokroků a vývoje v jednotlivých okruzích.
|
|
Předpoklady
|
nespecifikováno
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
nespecifikováno
Kurs je ukončen ústní zkouškou. Podmínkou účasti na zkoušce je předchozí udělení zápočtu. Zápočet je udělen v případě nejméně 80% účasti na cvičení a je podmíněn odevzdáním protokolů, které musí být vyučujícím uznány.
|
|
Doporučená literatura
|
-
původní vědecké články vztahující se k jednotlivým tématům..
-
Aislabie J, Deslippe JR (2013). Soil microbes and their contribution to soil services. In: Dymond JR ed. Ecosystem.
-
D. MARCO (editor). METAGENOMICS: CURRENT INNOVATIONS and FUTURE TRENDS. Caister Academic Press, 2011.
-
Gryndler M (2011). Biologie půdních mikroorganismů: podpůrný text k přednášce.
-
H. ZHAO (editor). SYNTHETIC BIOLOGY: TOOLS and APPLICATIONS. Academic Press, 2013.
-
Snyder, L. and Champness, W. MOLECULAR GENETICS OF BACTERIA, 2nd Ed., (ASM Press), 2003. a 3th Ed (ASM Press 2007)..
|