Předmět: IT v biologických vědách II

« Zpět
Název předmětu IT v biologických vědách II
Kód předmětu KBI/ITBV2
Organizační forma výuky Cvičení
Úroveň předmětu Bakalářský
Rok studia nespecifikován
Semestr Zimní a letní
Počet ECTS kreditů 3
Vyučovací jazyk Čeština
Statut předmětu Povinně-volitelný
Způsob výuky nespecifikováno
Studijní praxe nespecifikováno
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Štofik Marcel, Mgr. Ph.D.
Obsah předmětu
Kurz je tvořen pracovními semináři, jejichž obsahem bude: - Instalace a samostatná práce s programem R a programy, které mohou sloužit na obsluhu programu R nebo psaní skriptů (TinnR a StudioR). - Instalace nových programových balíčků a práce s nimi. - Práce s nápovědou programu, která má velký význam pro další samostatnou páci s programem. - Tvorba skriptů, které jsou základem práce s programem R. - Úprava a použití vybraných typů objektů programu, které jsou základem pro manipulaci s daty. Bude mezi ně patřit hlavně vektor, matice (pole), seznam a datová tabulka. - Psaní vlastních funkcí a používání cyklů a podmínek využitelných při zpracování dat. - Zvládnutí základní a pokročilé grafiky v programu R, ke které patří práce s high-level a low-level grafickými funkcemi. Studenti se naučí vytvářet různé modifikace grafů. - Ukázka vybraných postupů pro zpracování a vyhodnocení experimentálně naměřených dat (způsoby vyhodnocení experimentálních dat a závislostí, prokládání křivek, možnosti modelování, popisná statistická analýza). - Seznámení se s komerčním programem pro zpracování dat (zkušební verze programu SigmaPlot.) a jeho možnostmi ve srovnání s programem R.

Studijní aktivity a metody výuky
nespecifikováno
Výstupy z učení
Kurz je zaměřen na pokročilejší způsoby zpracování experimentálních dat v podobě kvalitních grafických výstupů. Hlavním cílem kurzu je zvládnutí samostatné práce s programem R a příprava grafických výstupů pomocí tohoto programu. Tento kurz byl vytvořen v rámci projektu CZ.1.07/2.2.00/28.0296 "Mezioborové vazby a podpora praxe v přírodovědných a technických studijních programech UJEP"

Předpoklady
Student umí samostatně pracovat s osobním počítačem, umí instalovat doporučené programy a zvládá pasivně používat anglický jazyk na základní až pokročilé úrovni.

Hodnoticí metody a kritéria
nespecifikováno
Kontrola zvládnutí obsahu učiva bude provedena závěrečným testem a průběžně formou individuálních prací, dle konkrétního zadání.
Doporučená literatura
  • Mittal H. R Graph Cookbook. Packt Publishing, 2011.
  • Murrell, P. R. Graphics, Second Edition. Chapman & Hall/CRC, 2011.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biologie (A14) Kategorie: Biologické obory 1 Doporučený ročník:1, Doporučený semestr: Letní