1. Úvod do studia biologie prokaryot a virů Obecná charakteristika prokaryot a virů, jejich postavení v soustavě živých systémů. Historie mikrobiologie. Společenský význam mikrobů. 2. Biologie virů Obecná charakteristika virů; struktura a chemické složení virů; klasifikace virů (podle genomu, podle hostitele). Interakce virus ? hostitel; virová infekce; reprodukční strategie virů. Využití virů v biotechnologiích. Základy epidemiologie (principy, pojmy, protiepidemická opatření, vakcíny). 3. Morfologie prokaryotické buňky Cytoplazmatická membrána; cytoplasma, nukleoid, plazmidy, ribozomy, endospory, inkluze; povrchové útvary (buněčná stěna, pouzdro a glykokalyx, biofilm; prokaryotický bičík, fimbrie); tvary bakteriálních buněk a kolonií. 4. Růst a množení bakterií růstová křívka, statická a kontinuální kultivace (turbidostat, chemostat). Působení fyzikálních a chemických faktorů zevního prostředí na bakterie (teplota, vlhkost, osmotický tlak, hydrostatický tlak, záření, pH, dezinfekční látky, antibiotika). 5. Genetika prokaryot I. Genom prokaryotické buňky (nukleoid, plazmidy, profág). Horizontální přenos genetické informace (konjugace, transdukce, transformace). Přenos faktorů virulence a rezistence na antibiotika. Využití při genových manipulacích. 6. Genová exprese u bakterií Operon, spřažení transkripce a translace. Regulace genové exprese u prokaryot. 7. Primární metabolismus bakterií Klasifikace bakterií podle zdroje uhlíku (autotrofie, heterotrofie), zdroje energie (fototrofie, chemolitotrofie). Metabolismus chemoorganotrofních bakterií ? aerobní/anaerobní respirace, fermentace. Metabolismus chemolitotrofních bakterií ? oxidace amoniaku, vodíku, metanu, sloučenin síry a železa. Fototrofní bakterie. 8. Sekundární metabolismus bakterií Definice bioaktivní látky, bakteriální hormony (přenos vnějších signálů, quorum sensing), exotoxiny, antibiotika ? mechanismy účinku a rezistencí. 9. Základy taxonomie prokaryot Nomenklatura a klasifikace prokaryot; přehled a obecná charakteristika hlavních skupin prokaryot (domény Archaea, Bacteria; kmeny, třídy a jejich významní zástupci). 10. Metody identifikace virů a bakterií Principy správného odběrtu a transportu biologického materiálu; přímé a nepřímé identifikační metody (genotypové, chemotypové a sérologické), metody moderní diagnostiky klinických infekcí. 11. Základy ekologie prokaryot Obecná charateristika mikrobiálních ekosystémů; příklady bakteriálních symbióz a parazitismů 12. Vztah mikrob a hostitel Normální mikrobiální osídlení lidského těla, patogenita a virulence, nejčastější infekční nákazy lidského těla a jejich léčba. Přirozená a získaná imunita hostitele. Charakteristika cvičení Zásady práce v mikrobiologické laboratoři. Mikrobiologická technika. Sterilizace. Příprava živných půd. Očkování vzorků na agarové plotny ? vzorky vody, půdy, potravin. Kultivace mikroorganismů. Izolace čistých kultur bakterií. Stanovení počtu živých buněk. Ředění bakteriální kultury. Výsev na plotny. Růstová křivka bakteriální kultury. Stanovení plating efficiency. Nativní preparáty. Gramovo barvení. Identifikace kultivovaných mikroorganismů. Rezistence na antibiotika. Izolace bakteriální DNA. PCR. Expoziční testy.
|